La nave fu convertita e allestita a Emden e Wilhelmshaven, dove fu messa in servizio il 16 ottobre 1941 con il numero Felpost M 07995 e da dove fu trasferita a Nantes il 31 dicembre 1941. La conversione aveva creato spazio per 102 cuccette per malati (doppie cuccette) in due ponti. All'inizio di febbraio 1942 a bordo c'erano 2 ufficiali medici, più 4 sottufficiali e 14 uomini. In un elenco dell'equipaggio civile del marzo 1944, oltre al capitano Heinrich Stehrenberg, ci sono altri 19 membri della Basatzung. Sette di loro, non solo ufficiali, avevano ricevuto la Croce al Merito di Guerra, Seconda Classe con Spade, negli anni 1941-1943. Il primario era Marine Staffarzt d.R. Il dottor Werner Schmidt dall'ottobre 1941 all'agosto 1942, il capo medico della marina, il dottor Joachim Nickol, fino all'affondamento della nave.
All'inizio del 1942 l'Huxter si trasferì a St. Malo, da dove venivano effettuati viaggi regolari nelle Isole del Canale britanniche Jersey, Guernsey e Alderney, ciascuno dei quali richiedeva solo circa due giorni. Sono stati ammessi non solo soldati malati e feriti, ma anche lavoratori stranieri. L'intero servizio di trasporto non è documentato. Il dottor Nickol in seguito ha stimato che fossero "al sicuro oltre 1.000 feriti e malati". Intorno al Natale del 1943, la nave a Le Havre ricevette paratie aggiuntive, attraverso le quali furono creati cinque compartimenti stagni. Per il resto, l'Huxter è rimasto in costante prontezza operativa perché doveva essere disponibile ad aiutare rapidamente in caso di battaglie navali e incidenti aerei nella zona di mare.
La nave ospedale era sempre ancorata al largo di St. Malo in rada, ben separata da tutte le navi da guerra. Anche così, ha subito due attacchi aerei nemici che l’ hanno colpita. Il primo attacco avvenne a fine marzo/inizio aprile 1944 con tempo sereno con bombe e spari, i cui proiettili penetrano la nave ospedale dall'alto verso il basso, ma senza causare ulteriori danni. Il secondo attacco avvenne il 7 giugno, poco dopo l'inizio dell'invasione alleata della Normandia. Il dottor Nickol, ora primario, ha descritto l'evento:
"La nave era sola e chiaramente separata da qualsiasi altra struttura militare. L'attacco ha avuto luogo con tempo luminoso e sereno, sole e cielo senza nuvole. I
cacciabombardieri in picchiata hanno sganciato una serie di bombe, nessuna delle quali ha colpito direttamente la nave ma erano così vicine al fianco della nave, a babordo, a dritta, e intorno alla poppa che la forza delle detonazione ha provocato danni importanti alla nave.Le paratie laterali erano ammaccate in vari punti e scoppiò un incendio, ma fu subito contenuto. La nave fu presto messa in sicurezza , solo attraverso l'intervento immediato, l'assistenza e il supporto di diverse imbarcazioni dell'avamposto con le loro pompe di sentina, per esssere poi rimorchiata nel porto di St. Malo.
Nel diario di guerra del comando di guerra navale il 7 giugno 1944 ore 12:00 si annotò solo brevemente: "(...) La nave ospedale Huxter ricevette colpi di bomba e fece acqua". La perdita dell'Huxter, che non poteva più essere riparata, fu tanto più grave perché in quel momento fu chiesto urgentemente all'esercito di verificare se una nave ospedale potesse essere collocata immediatamente nella zona di mare tra la Bretagna e la Normandia a causa del numero crescente di feriti.